Αναπόσπαστο κομμάτι της λειτουργίας του Νοσοκομειακού Φαρμακείου, είναι η προετοιμασία και η διάλυση ενέσιμων κυτταροστατικών και βιολογικών φαρμάκων, που απαιτούν άσηπτες συνθήκες παρασκευής. Η λειτουργία της μονάδας διάλυσης φαρμάκων, στηρίζεται σε αυστηρές διαδικασίες και πρωτόκολλα, τα οποία ακολουθούνται πιστά, από έμπειρο και εκπαιδευμένο προσωπικό του φαρμακείου και της ογκολογικής νοσηλευτικής. Τόσο η έκδοση των φαρμάκων όσο και η διαδικασία διάλυσής τους, γίνεται εξατομικευμένα, σε ελεγχόμενες συνθήκες, βάση των πρωτοκόλλων φαρμακοθεραπείας που εφαρμόζονται.