Αντικείμενο του Νοσοκομειακού Φαρμακείου, είναι η αποτελεσματική παροχή φαρμακευτικών υπηρεσιών, με στόχο την ορθολογική και ασφαλή διαχείρηση των φαρμάκων εντός του Νοσοκομείου. Το Νοσοκομειακό φαρμακείο, στελεχώνεται από τον Διευθυντή του Φαρμακείου, δύο φαρμακοποιούς και τρεις τεχνικούς φαρμακείου.

Το Νοσοκομειακό Φαρμακείο έχει την αρμοδιότητα της προμήθειας, της ασφαλούς φύλαξης καθώς και της διανομής των φαρμάκων, στα διάφορα τμήματα και στους θαλάμους νοσηλείας του Νοσοκομείου. Για την ασφαλή έκδοση ελεγχόμενων φαρμάκων, για τους εσωτερικούς ασθενείς του Νοσοκομείου, εκτελούνται από το Φαρμακείο δελτία θεραπείας, στα οποία αναγράφεται από τον ιατρό, η κατάλληλη φαρμακευτική αγωγή.

Το Νοσοκομειακό Φαρμακείο, εμπλέκεται στην εκτέλεση των πρωτοκόλλων χημειοθεραπείας και στη διάλυση των χημειοθεραπευτικών φαρμάκων. Συγκεκριμένα οι φαρμακοποιοί, ελέγχουν την ορθότητα του πρωτοκόλου και υπολογίζουν τον όγκο του φαρμάκου που πρέπει να χρησιμοποιηθεί, στη διάλυση των ενέσιμων φαρμάκων θεραπείας του καρκίνου, στην οποία συμμετέχουν και οι τεχνικοί φαρμακείου. 

Από τη θυρίδα του Νοσοκομειακού Φαρμακείου, εξυπηρετούνται εξωτερικοί ασθενείς για την εκτέλεση των πιο κάτω συνταγών:

• Συνταγές ΓΕΣΥ με φάρμακα της 2^ης φάσης του ΓΕΣΥ, που κυρίως αφορούν φάρμακα θεραπείας του καρκίνου, αντιεμετικά φάρμακα, οπιοειδή και φάρμακα υποστηρικτικής αγωγής.
• Συνταγές ΓΕΣΥ, με Μη Συνταγογραφούμενα Φάρμακα, που καλύπτονται από το ΓΕΣΥ, σε ειδικές κατηγορίες ασθενών όπως είναι οι καρκινοπαθείς και οι νεφροπαθείς.
• Συνταγές με φάρμακα, που εγκρίνονται από την Επιτροπή Ονομαστικών Αιτημάτων του Υπουργείου Υγείας.

Παράλληλα το Νοσοκομειακό Φαρμακείο παρέχει υπηρεσίες Κλινικής Φαρμακευτικής, με τη δημιουργία  πρωτοκόλλων φαρμακοθεραπείας και με την εμπλοκή στην παρεχόμενη φροντίδα υγείας στον ασθενή. Στόχος του Νοσοκομειακού Φαρμακείου είναι η χορήγηση του σωστού φαρμάκου, στη σωστή δόση, στο σωστό ασθενή.